Banques de données bioinformatiques

Le Mésocentre Clermont Auvergne fournit un accès à des banques de données biologiques publiques. Leurs mises à jours sont gérées par BioMAJ. Les données brutes proviennent de sites distants (NCBI, flybase, UCSC, ...) et sont indexées automatiquement pour être utilisées ensuite par les différents outils sur le cluster de calcul ou via le serveur web Galaxy.

La liste des banques de données disponibles et les informations afférentes sont accessibles grâce à l'interface BioMAJWatcher. Si vous avez besoin d'une banque de données publique non disponible ou d'index spécifiques, merci d'envoyer un ticket a support.dsi@uca.fr en précisant le nom de la banque, et selon soit l'adresse URL de téléchargement (ftp si possible) ou le format de l'index désiré.